MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015183	CCG	2	6	25851	25856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291477
502	NC_015183	CG	3	6	25855	25860	0 %	0 %	50 %	50 %	325291477
503	NC_015183	ATG	2	6	25910	25915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291477
504	NC_015183	CTC	2	6	26005	26010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291477
505	NC_015183	ACG	3	9	26039	26047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291477
506	NC_015183	CTG	3	9	26082	26090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291477
507	NC_015183	ACG	2	6	26117	26122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291477
508	NC_015183	AGA	2	6	26232	26237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291477
509	NC_015183	CCG	2	6	26259	26264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291477
510	NC_015183	CCA	2	6	26272	26277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291477
511	NC_015183	TTC	2	6	26326	26331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291477
512	NC_015183	CATCG	2	10	26338	26347	20 %	20 %	20 %	40 %	325291477
513	NC_015183	GC	5	10	26361	26370	0 %	0 %	50 %	50 %	325291477
514	NC_015183	GCTG	2	8	26392	26399	0 %	25 %	50 %	25 %	325291477
515	NC_015183	GTG	2	6	26409	26414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291477
516	NC_015183	ATGG	2	8	26422	26429	25 %	25 %	50 %	0 %	325291477
517	NC_015183	GC	3	6	26473	26478	0 %	0 %	50 %	50 %	325291477
518	NC_015183	GCCG	2	8	26490	26497	0 %	0 %	50 %	50 %	325291477
519	NC_015183	GAA	2	6	26548	26553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291477
520	NC_015183	GTC	2	6	26560	26565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291477
521	NC_015183	AGA	2	6	26618	26623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291477
522	NC_015183	GCA	2	6	26640	26645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291477
523	NC_015183	CA	3	6	26742	26747	50 %	0 %	0 %	50 %	325291477
524	NC_015183	GAT	2	6	26853	26858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291478
525	NC_015183	TTCT	2	8	26934	26941	0 %	75 %	0 %	25 %	325291478
526	NC_015183	CAT	2	6	26990	26995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291478
527	NC_015183	CAG	2	6	26997	27002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291478
528	NC_015183	ACC	2	6	27034	27039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291478
529	NC_015183	AG	3	6	27084	27089	50 %	0 %	50 %	0 %	325291478
530	NC_015183	GGT	2	6	27117	27122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291478
531	NC_015183	GAA	2	6	27171	27176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291478
532	NC_015183	TCA	2	6	27305	27310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291478
533	NC_015183	TCG	2	6	27322	27327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291478
534	NC_015183	ATC	2	6	27370	27375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291478
535	NC_015183	GAC	2	6	27399	27404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291478
536	NC_015183	TCT	2	6	27407	27412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291478
537	NC_015183	ATC	2	6	27451	27456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291478
538	NC_015183	CGG	2	6	27527	27532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291478
539	NC_015183	TGCGC	2	10	27748	27757	0 %	20 %	40 %	40 %	325291479
540	NC_015183	ATG	2	6	27762	27767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291479
541	NC_015183	CTCGT	2	10	27806	27815	0 %	40 %	20 %	40 %	325291479
542	NC_015183	ATC	2	6	27918	27923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291479
543	NC_015183	ATA	2	6	28064	28069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325291479
544	NC_015183	CCA	2	6	28126	28131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291479
545	NC_015183	TCGA	2	8	28160	28167	25 %	25 %	25 %	25 %	325291479
546	NC_015183	AGG	2	6	28169	28174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291479
547	NC_015183	TGC	2	6	28186	28191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291479
548	NC_015183	GCG	2	6	28236	28241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291479
549	NC_015183	CCCG	2	8	28306	28313	0 %	0 %	25 %	75 %	325291479
550	NC_015183	AGG	2	6	28323	28328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291479
551	NC_015183	CCG	2	6	28348	28353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291479
552	NC_015183	GC	3	6	28366	28371	0 %	0 %	50 %	50 %	325291479
553	NC_015183	GCG	3	9	28734	28742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291479
554	NC_015183	TCG	2	6	28785	28790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291479
555	NC_015183	GAT	2	6	28874	28879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291479
556	NC_015183	GCG	2	6	29093	29098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291480
557	NC_015183	GCCGG	2	10	29152	29161	0 %	0 %	60 %	40 %	325291480
558	NC_015183	AGGCCA	2	12	29216	29227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291480
559	NC_015183	CCG	2	6	29236	29241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291480
560	NC_015183	CCG	2	6	29243	29248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291480
561	NC_015183	CG	3	6	29253	29258	0 %	0 %	50 %	50 %	325291480
562	NC_015183	CGCTG	2	10	29343	29352	0 %	20 %	40 %	40 %	325291480
563	NC_015183	ATTG	2	8	29389	29396	25 %	50 %	25 %	0 %	325291480
564	NC_015183	GAG	2	6	29404	29409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291480
565	NC_015183	TGA	2	6	29412	29417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291480
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567	NC_015183	CGA	2	6	29472	29477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291480
568	NC_015183	AGT	2	6	29562	29567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291480
569	NC_015183	ATG	2	6	29576	29581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291480
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571	NC_015183	CTGC	2	8	29667	29674	0 %	25 %	25 %	50 %	325291480
572	NC_015183	GCG	2	6	29739	29744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291480
573	NC_015183	TTC	2	6	29780	29785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291480
574	NC_015183	TCG	2	6	29789	29794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291480
575	NC_015183	CGT	2	6	29808	29813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291480
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579	NC_015183	GCCA	2	8	29997	30004	25 %	0 %	25 %	50 %	325291480
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581	NC_015183	CGG	2	6	30075	30080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291480
582	NC_015183	CGTC	2	8	30125	30132	0 %	25 %	25 %	50 %	325291480
583	NC_015183	CGC	2	6	30255	30260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291480
584	NC_015183	GA	3	6	30334	30339	50 %	0 %	50 %	0 %	325291480
585	NC_015183	GCT	2	6	30384	30389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291480
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590	NC_015183	CCGC	2	8	30641	30648	0 %	0 %	25 %	75 %	325291480
591	NC_015183	GAA	2	6	30670	30675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291480
592	NC_015183	ACC	2	6	30692	30697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291480
593	NC_015183	TCT	2	6	30747	30752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291480
594	NC_015183	CG	3	6	30807	30812	0 %	0 %	50 %	50 %	325291480
595	NC_015183	TTCGCC	2	12	30853	30864	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325291480
596	NC_015183	GCC	2	6	30870	30875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291480
597	NC_015183	TCGA	2	8	30887	30894	25 %	25 %	25 %	25 %	325291480
598	NC_015183	GCGCTC	2	12	30934	30945	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325291480
599	NC_015183	GC	3	6	30968	30973	0 %	0 %	50 %	50 %	325291480
600	NC_015183	GTT	2	6	30976	30981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291480
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602	NC_015183	CG	3	6	30995	31000	0 %	0 %	50 %	50 %	325291480
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608	NC_015183	CCAG	2	8	31362	31369	25 %	0 %	25 %	50 %	325291480
609	NC_015183	ACG	2	6	31370	31375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291480
610	NC_015183	CG	3	6	31445	31450	0 %	0 %	50 %	50 %	325291480
611	NC_015183	GCGCCA	2	12	31476	31487	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325291480
612	NC_015183	GTCT	2	8	31674	31681	0 %	50 %	25 %	25 %	325291481
613	NC_015183	CGC	2	6	31727	31732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291481
614	NC_015183	GC	3	6	31795	31800	0 %	0 %	50 %	50 %	325291481
615	NC_015183	A	6	6	31801	31806	100 %	0 %	0 %	0 %	325291481
616	NC_015183	CG	3	6	31812	31817	0 %	0 %	50 %	50 %	325291481
617	NC_015183	TCG	2	6	32001	32006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291482
618	NC_015183	GCA	2	6	32017	32022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291482
619	NC_015183	TGGT	2	8	32082	32089	0 %	50 %	50 %	0 %	325291482
620	NC_015183	ACG	2	6	32092	32097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291482
621	NC_015183	GAAG	2	8	32108	32115	50 %	0 %	50 %	0 %	325291482
622	NC_015183	CAG	2	6	32141	32146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291482
623	NC_015183	CAG	2	6	32159	32164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291482
624	NC_015183	ATG	2	6	32166	32171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291482
625	NC_015183	AGCGA	2	10	32238	32247	40 %	0 %	40 %	20 %	325291482
626	NC_015183	CGA	2	6	32281	32286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291482
627	NC_015183	TTG	2	6	32334	32339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291482
628	NC_015183	GGT	3	9	32342	32350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291482
629	NC_015183	GGC	2	6	32411	32416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291482
630	NC_015183	GC	3	6	32422	32427	0 %	0 %	50 %	50 %	325291482
631	NC_015183	GGC	2	6	32480	32485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291482
632	NC_015183	GCCA	2	8	32531	32538	25 %	0 %	25 %	50 %	325291482
633	NC_015183	TCA	2	6	32539	32544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291482
634	NC_015183	GCG	2	6	32555	32560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291482
635	NC_015183	TGT	2	6	32596	32601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291482
636	NC_015183	ACTTGG	2	12	32605	32616	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325291482
637	NC_015183	CGTTGA	2	12	32626	32637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325291482
638	NC_015183	AGG	2	6	32652	32657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291482
639	NC_015183	CTT	2	6	32660	32665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291482
640	NC_015183	GTC	2	6	32694	32699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291482
641	NC_015183	TTC	2	6	32702	32707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291482
642	NC_015183	GCT	2	6	32731	32736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291482
643	NC_015183	TTG	2	6	32769	32774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291482
644	NC_015183	CTT	2	6	32797	32802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291482
645	NC_015183	GC	5	10	32841	32850	0 %	0 %	50 %	50 %	325291482
646	NC_015183	TGG	2	6	32866	32871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291482
647	NC_015183	CGC	2	6	32875	32880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291482
648	NC_015183	CAT	2	6	32881	32886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291482
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650	NC_015183	GCCG	2	8	32990	32997	0 %	0 %	50 %	50 %	325291482
651	NC_015183	GCT	2	6	33006	33011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291482
652	NC_015183	A	6	6	33031	33036	100 %	0 %	0 %	0 %	325291482
653	NC_015183	TTTCGG	2	12	33193	33204	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325291482
654	NC_015183	GAT	2	6	33251	33256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291482
655	NC_015183	CTT	2	6	33411	33416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291483
656	NC_015183	CAA	2	6	33432	33437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291483
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658	NC_015183	GCC	2	6	33512	33517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291483
659	NC_015183	CAT	2	6	33520	33525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291483
660	NC_015183	ATG	2	6	33533	33538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291483
661	NC_015183	CCA	2	6	33545	33550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291483
662	NC_015183	TCG	2	6	33579	33584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291483
663	NC_015183	TTG	2	6	33644	33649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291483
664	NC_015183	CTT	2	6	33690	33695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291484
665	NC_015183	AT	3	6	33728	33733	50 %	50 %	0 %	0 %	325291484
666	NC_015183	TGT	2	6	33774	33779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291484
667	NC_015183	GTT	2	6	33850	33855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291484
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669	NC_015183	CAT	2	6	33924	33929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291484
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693	NC_015183	GC	3	6	34993	34998	0 %	0 %	50 %	50 %	325291486
694	NC_015183	ACG	2	6	35051	35056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291486
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705	NC_015183	GCG	2	6	35547	35552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291486
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720	NC_015183	GGAT	2	8	36383	36390	25 %	25 %	50 %	0 %	325291486
721	NC_015183	GGC	2	6	36396	36401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291486
722	NC_015183	CAA	2	6	36460	36465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291486
723	NC_015183	CTT	2	6	36596	36601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291487
724	NC_015183	GTC	2	6	36635	36640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291487
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732	NC_015183	GGCGC	2	10	36890	36899	0 %	0 %	60 %	40 %	325291487
733	NC_015183	CCA	2	6	36919	36924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291487
734	NC_015183	TGA	2	6	36949	36954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291487
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737	NC_015183	GCG	2	6	37108	37113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291487
738	NC_015183	CCGT	2	8	37146	37153	0 %	25 %	25 %	50 %	325291487
739	NC_015183	CGAT	2	8	37189	37196	25 %	25 %	25 %	25 %	325291487
740	NC_015183	GTC	3	9	37217	37225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291487
741	NC_015183	CGG	2	6	37722	37727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291488
742	NC_015183	TCG	2	6	37785	37790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
743	NC_015183	TGG	2	6	37820	37825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291488
744	NC_015183	ACA	3	9	37827	37835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291488
745	NC_015183	GCT	2	6	37861	37866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
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747	NC_015183	CGG	2	6	37924	37929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291488
748	NC_015183	GTC	2	6	37961	37966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
749	NC_015183	CAT	2	6	38056	38061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291488
750	NC_015183	CGG	2	6	38155	38160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291488
751	NC_015183	CCT	2	6	38163	38168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291488
752	NC_015183	AAG	2	6	38183	38188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291488
753	NC_015183	CTG	2	6	38213	38218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
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999	NC_015183	CGA	2	6	51121	51126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291502
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